COVID-19 大流行已經持續了近 3 年，目前仍然是一個全球關注的熱點話題。鑒于新冠病毒的廣泛傳播和不斷演變，全球出現了眾多變種，比如 alpha (B.1.1.7)、beta (B.1.351)、gamma (P.1)、delta (B.1.617.2)、omicron (B.1.1.529) 等。其中，Omicron *早在南非被發現，增加的高傳播力使其迅速成為全球范圍內的優勢毒株。
2022 年 12 月之前，中國采取了與其他國家不同的應對策略，從 2020 年的武漢封城到動態清零政策，精準防控，阻止了新冠病毒的傳播。隨著 Omicron 亞變體致病性的減弱、疫苗接種的普及和防控經驗的積累，2022 年 11 月中旬，中國調整和優化了預防和控制策略。
中國在調整防控政策后，疫情在中國的快速傳播引起了世界的關注，并引發了人們對此次疫情是否會驅動新 SARS-CoV-2 變體出現的擔憂。因此，對流行的 SARS-CoV-2 變體進行**的時空研究，對于全球應對當前的 COVID-19 大流行至關重要。北京擁有常住人口 2100 萬，在政策調整后初期成為中國病例數*多的城市之一。因此，北京 SARS-CoV-2 變種的流行可以被視為中國的一個縮影。
2023 年 2 月 8 日，北京疾控中心副主任王全意團隊聯合高福院士團隊在國際權威醫學期刊《柳葉刀》發表了題為：Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis 的論文，**描述了 2022 年收集的高質量 SARS-CoV-2 全基因組序列的流行病學和系統發育特征，并特別報道分析了政策調整后 SARS-CoV-2 的基因組特征，為北京市疫情提供了重要信息。
其中，從 2022 年 11 月 14 日到 12 月 20 日獲得的 413 個 COVID-19 感染樣本的基因組測序分析結果表明，所有病例均由現有毒株引起，北京地區 90% 以上的本地感染病例涉及 Omicron 變異株 BA.5.2 和 BF.7，沒有持續的顯性變異或新的譜系產生
2022 年 1 月 1 日至 11 月 30 日，北京市共監測到 39007 例本地病例，5 歲以下和 60 歲以上的個體占 663 人 (1.70%)。由于戰略調整，自 11 月 14 日起，感染人數明顯增加，因此，當地 11 月 30 日至 12 月 28 日的準確感染人數是未知的，只能通過統計推斷得到。
北京市 2022 年檢測到的本地和輸入性病例中，實驗室確診病例共計 3745 例，本研究從中隨機選取病例進行基因組測序，共獲得 2994 個完整的 SARS-CoV-2 基因組，其中 2881 個是高質量基因組，可用于進一步分析。這些序列的采樣時間跨度為全年，采樣地點覆蓋了北京市全部 17 個區。
詳細的分析表明，這些毒株來自 10 個演化支和 123 個 Pango lineage。與本地病例相比，輸入性病例的分支范圍更廣。不過，在所分析的數據集中沒有發現新的 Pango lineage。此外，他們還發現了少量先前報道的重組 SARS-CoV-2 亞變體 XBB (n = 1)，XBB.1 (n = 9) 和 XBB.2 (n = 1)。從全年的角度來看，來自支系 21L (BA.2.2.1) 和 22B/Omicron (BF.7 和 BA.5.2) 在 2022 年期間主導了北京的流行感染。但 2022 年 11 月中旬之后，22B 在北京成為**主導流行毒株。
自 2022 年 11 月 14 日起，北京市新增確診病例大幅增加，共檢測確診病例 413 例，其中本地病例 350 例，境外輸入病例 63 例。在這些本地病例中，BF.7 占 265 株 (75.71%)，成為 11 月 14 日以后的優勢菌株，BA.5.2（16.29%）和 BA.5.1（7.71%）分列**和第三。
他們進一步將本地感染分為門診患者和住院患者，發現兩組中優勢菌株均為 BF.7，這與局部感染總體一致，門診患者與住院患者的病毒株比例差異無統計學意義。
因此，在中國取消*嚴格的疫情控制政策期間，對北京 413 例新感染 COVID-19 病例的基因組分析表明，所有病例都是由現有菌株引起的，并未出現新的變異株。
進一步的系統動力學分析表明，BA.5.2 和 BF.7 的有效群體大小在 2022 年 11 月 14 日之后經歷了擴張，這表明這兩個毒株的遺傳多樣性有所增加。不過，BA.5.2 和 BF.7 的擴張模式不同，BA.5.2 有效種群規模在 11 月 14 日至 25 日期間變化不大，但在 11 月 25 日前后急劇增加；而 BF.7 的增加卻是漸進式的。北京市 BA.5.2 有效種群規模的突然擴大與 11 月 30 日前后 BA.5.2 感染數量的增加是一致的。此外，在*近的疫情中，他們沒有發現任何新的 SARS-CoV-2 變種在北京傳播。
綜上所述，在本研究中，他們報告了 2022 年北京地區 COVID-19 病例和 SARS-CoV-2 變體的傳播趨勢。流行病學調查和系統發育分析表明，本地和輸入性感染在譜系分布上存在顯著差異。2023 年 11 月 14 日至 12 月 20 日，BF.7 和 BA.5.2 在北京本地感染中占主導地位，沒有發現新的 SARS-CoV-2 變種在北京傳播。在同一時期，在國際上占主導地位的新冠病毒變體，包括 XBB 和 BQ.1，均未在北京市本地感染病例中檢出。總的來說，該研究可以被認為是中國的一個縮影，因為中國的人交流頻繁，而且流行的菌株具有很高的傳播性。
該研究共同通訊作者、中國科學院微生物研究所高福院士說到：「考慮到變異對大流行過程的影響，檢測在中國*近改變 COVID-19 防控政策后是否出現了新的變異很重要。我們的分析表明，兩個已知的 Omicron 變異株亞分支，而不是任何新的變異株，是北京病例數激增的主要原因，這種現象也很可能反映了整個中國的狀態。然而，隨著 COVID-19 在中國的大規模傳播，繼續密切監測是非常重要的，以便盡早發現任何可能出現的新變體。
在同期的評論性文章中，泰倫博斯大學醫學與健康科學學院 Wolfgang Preiser 教授和 Tongai Maponga 博士寫道：「很高興看到來自中國的這些急需的數據。令人欣慰的是，這項研究沒有發現新變異的證據，但這并不令人驚訝，前期有效的疫情控制措施的突然停止充分解釋了這種激增。
然而，他們仍然指出，在根據北京的數據對中國整體得出結論時要慎，他們提到：「在一個幅員遼闊、人口稠密的國家的一個地區發生的 SARS-CoV-2 分子流行病學并不能外推到整個國家。在中國的其他地區，其他的進化動態可能會展開，可能包括被人類感染的動物物種，*終很有可能進一步造成病毒的進化和『回溢』。因此，嚴密的檢測仍然是必須持續進行的。
