蛋白質組學雖然問世時間很短，但已經在研究細胞的增殖、分化、異常轉化、腫瘤形成等方面進行了有力的探索，涉及到白血病、乳腺癌、結腸癌、膀胱癌、前列腺癌、肺癌、腎癌和神經母細胞瘤等，鑒定了一批腫瘤相關蛋白，為腫瘤的早期診斷、藥靶的發現、療效判斷和預后提供了重要依據。
 

　　鑒于蛋白質組學發展前景的重要性和技術的先進性，西方各主要發達國家紛紛投巨資**啟動蛋白質組的研究。如美國國立衛生研究院，美國能源部、歐共體等均啟動了不同生物蛋白質組的研究并取得明顯進展，一批高質量的研究論文相繼在國際有名學術刊物發表。由于蛋白質組學研究比基因組學研究更接近實用，有著巨大的市場前景，企業與制藥公司也紛紛斥巨資開展蛋白質組研究。獨立完**類基因組測序的Celera公司已宣布投資上億美元于此領域；日內瓦蛋白質組公司與布魯克質譜儀制造公司聯合成立了國際上*大的蛋白質組研究中心。為了促進國家與地區性的蛋白質組的發展、合作與交流，成立了國際人類蛋白質組組織(HUPO)，在法國召開了首屆國際蛋白質組大會，并迅即在北美、歐洲、韓國、日本成立了相應的分支機構。蛋白質組學已成為西方各主要發達國家、各跨國制藥集團競相投入的“熱點”。